由于以上种种举动，科根在圈内的人缘急剧恶化，但他和詹伯林始终是好朋友。科根作为客串歌手为詹伯林的乐队“吉米·詹伯林复合体”（ The Jimmy Chamberlin Complex）的首张专辑《生活重新开始（Life Begins Again）》里的歌曲《洛基猫（Loki Cat）》献唱。作为礼尚往来，詹伯林也为科根的首张个人专辑里的歌曲《DIA》打鼓。

个人专辑里的造型

科根在2004年末发行了一本诗集，《笑里藏刀（Blinking with Fists）》。这本书甫一问世便登上了《纽约时报》的销量冠军，同时在第一周里也是美国销量最高的诗集。

2005年6月21日，科根在“重奏”公司（Reprise）旗下发行了自己的首张个人专辑《未来的拥抱（TheFutureEmbrace）》。媒体反映冷淡，专辑只卖出了六万九千张。个人专辑发行后，科根跟他的巡演乐队（琳达·斯特罗贝莉/Linda Strawberry、布莱恩·莱瑟刚/Brian Liesegang和马特·沃克）一起办了巡演，但规模远不如“了不起的蠢货”和“天鹅”的巡演。

在2006年2月3日RollingStone.com贴出的采访里，科特尼·拉芙（Courtney Love）表示科根正在为她即将发行的暂名为《脏女孩如何变干净（How Dirty Girls Get Clean）》的新专辑录一些歌曲。她还在一个采访里说她跟科根已经同居了四个月，他已经住进了自己位于好莱坞山的新寓所。

Corgan和Love，2007

10月29日，有消息称科根在跟“废物”乐队（Garbage）女主唱雪莉·曼森（Shirley Manson）一起为她的首张个人专辑写歌。

“蠢货”重组

2005年，在《旋转（Spin）》杂志的专访里，科根否决了“蠢货”乐队重组的可能性。他告诉记者，“如果我们七年后重返舞台，我会给你一大笔钱。”话音刚落，他就在芝加哥当地最有名的两家报纸（《芝加哥论坛报/The Chicago Tribune 》和《芝加哥太阳时代/The Chicago Sun-Times》上刊登整版的广告表达了自己重组“了不起的蠢货”的愿望。数天后，吉米·詹伯林接受了比利·科根的召唤。2006年1月1日，芝加哥论坛报揭晓了第十届“酒馆老板娘”奖，该奖项是以嘲讽上一年里引人关注的文化事件闻名。作为获奖者，评语说科根“用整版广告展示自己重组‘了不起的蠢货’的决心来为自己的首张个人专辑造势”，并说广告也是为了让詹姆士·伊哈和达西·雷茨基看到科根的想法。

传说中的广告

2005年12月11日，科根在他的MySpace空间上宣称一个大惊喜即将揭晓。他在帖子上说：“我为你们准备的惊喜等一切就绪之后就会宣布，稍安毋躁。总之，绝对值得大家期待，你们都等不及了吧？”

2006年1月开始，“了不起的蠢货”将在2006年4月加州印第欧市举办的Coachella音乐节上重组的传言在网络上甚嚣尘上。不过，音乐节官网随后公布的演出阵容证明这只是谣传。事后证实，这一谣言源自网上出现的一副PS过的音乐节海报。据曾跟科根所属厂牌“重奏”接触过的圣迭戈电台91-X XTRA-FM的音乐总监马尔克斯·柯林斯（Marcos Collins）说，“‘重奏’公司说比利无论如何不可能在那里出现。”之后，又有传言说乐队在2006年“杰出人物”（Lollapalooza）音乐节名单上，但也被证实是假的。尽管如此，针对2007年“杰出人物”音乐节的传言又开始传起来了，因为这次的演出在“蠢货”的根据地芝加哥举办。

2006年2月，MTV.com报道说科根和詹伯林已经以“了不起的蠢货”的名义新签了一家叫“前线”的经纪公司，报道援引梅丽莎·阿芙·德·莫尔的话加以证实。她肯定詹姆士·伊哈和达西·雷茨基将不会参与录音，并表示自己愿意加入重组的乐队，“我一直希望回去演奏自己喜欢的歌。如果达西不回来，我非常愿意二进宫。”